Hantu genetik menunjukkan awal pandemi di pasar

Sebuah tim ilmuwan mengatakan “tidak diragukan lagi” bahwa pandemi Covid dimulai dari hewan terinfeksi yang dijual di pasar, bukan dari kebocoran laboratorium.

Mereka menganalisis ratusan sampel yang dikumpulkan dari Wuhan, Tiongkok pada Januari 2020.

Hasilnya mengidentifikasi sejumlah hewan – termasuk anjing rakun, musang, dan tikus bambu – yang berpotensi menjadi sumber pandemi.

Meskipun penelitian tersebut menyoroti satu kios pasar sebagai hotspot bagi hewan dan virus corona, penelitian tersebut tidak memberikan bukti yang pasti.

Sampel-sampel ini dikumpulkan oleh otoritas Tiongkok pada tahap awal pandemi Covid-19 dan merupakan salah satu sumber informasi paling berharga secara ilmiah tentang asal mula pandemi ini.

Kaitan awal dengan pasar grosir makanan laut Huanan terjadi ketika pasien dengan pneumonia misterius muncul di rumah sakit di Wuhan.

Pasar ditutup dan tim membersihkan lokasi, termasuk kios, bagian dalam kandang hewan, dan peralatan yang digunakan untuk menghilangkan bulu dan bulu hewan yang disembelih.

Analisis mereka Diterbitkan tahun lalu Dan data mentahnya tersedia bagi ilmuwan lain. Kini sebuah tim di AS dan Prancis mengatakan mereka telah melakukan analisis genetik yang lebih canggih untuk melihat lebih dalam pada masa-masa awal Covid.

Hal ini melibatkan analisis jutaan fragmen kode genetik – baik DNA maupun RNA – untuk menentukan hewan dan virus mana yang ada di pasaran pada Januari 2020.

“Kami melihat hantu DNA dan RNA hewan-hewan ini dalam sampel lingkungan dan di kandang tempat beberapa virus Covid ditemukan,” kata Profesor Florence Debare dari Pusat Penelitian Ilmiah Nasional Prancis.

hasil, Diterbitkan di jurnal Cell, Soroti serangkaian temuan yang disatukan untuk mendukung argumen tersebut.

Ini menunjukkan deteksi virus corona dan hewan yang rentan di lokasi yang sama, mengumpulkan beberapa sampel individu dari hewan dan kode genetik virus corona. Distribusinya tidak merata di seluruh pasar dan mengacu pada hotspot tertentu.

“Dalam hal ini yang menunjuk pada pasar sebagai sumber epidemi ini – bahkan pada tingkat satu kios pun – kami menemukan cerita yang sangat konsisten,” kata Profesor Christian Anderson dari Scripps Institute di AS.

Namun, berada di tempat dan waktu yang sama tidak membuktikan bahwa hewan tersebut tertular.

Hewan yang paling sering dijadikan sampel adalah anjing rakun biasa. Telah terbukti menangkap dan menularkan Covid dalam percobaan.

Hewan lain yang diidentifikasi sebagai sumber potensial pandemi ini adalah musang bertopeng, yang dikaitkan dengan wabah SARS pada tahun 2003, serta tikus bambu dan landak Malaya. Tidak ada percobaan yang dilakukan untuk melihat apakah virus dapat menyebar.

Kedalaman analisis genetik mampu mengidentifikasi jenis anjing rakun tertentu yang dijual. Mereka lebih umum ditemukan di alam liar di Tiongkok selatan daripada dibudidayakan untuk diambil bulunya. Hal ini memberi para ilmuwan petunjuk tentang ke mana harus mencari selanjutnya.

Tim peneliti juga menganalisis kode genetik sampel virus yang ditemukan di pasaran dan membandingkannya dengan sampel pasien pada masa awal pandemi. Melihat berbagai jenis mutasi pada sampel virus juga dapat memberikan petunjuk.

Model menunjukkan, namun tidak membuktikan, bahwa Covid muncul lebih dari satu kali di pasar melalui dua peristiwa penyebaran dari hewan ke manusia. Para peneliti mengatakan bahwa hal ini mendukung gagasan bahwa pasar berasal dari tempat lain, dan bukan pandemi yang dimulai dari tempat lain, dengan pasar yang semakin memicu terjadinya penyebaran yang sangat besar.

Para ilmuwan juga menggunakan mutasi untuk membangun pohon keluarga virus dan memeriksa masa lalunya.

“Jika kami memperkirakan kapan epidemi dimulai, kami yakin kapan penyebaran di pasar dimulai, keduanya tumpang tindih, dan keduanya sama,” kata Profesor Anderson.

Dalam publikasi ilmiahnya, ditemukan keragaman genetik lengkap virus corona yang muncul pada masa awal pandemi di pasaran.

Profesor Michael Worobe dari Universitas Arizona mengatakan: “Daripada menjadi cabang kecil di pohon evolusi besar yang lebat ini, urutan pasar ada di semua cabang pohon, sesuai dengan variasi genetik yang sebenarnya dimulai dari pasar.”

Dia mengatakan penelitian tersebut, dikombinasikan dengan data lain – seperti kasus awal dan rawat inap yang terkait dengan pasar – semuanya menunjuk pada sumber hewani Covid-19.

Profesor Worobe berkata: “Tidak diragukan lagi bagaimana hal ini bisa terjadi”, dan penjelasan lain atas data tersebut memerlukan “skenario yang sangat tidak masuk akal”.

“Saya rasa masih ada yang kurang menghargai seberapa kuat bukti yang ada.”

Menurut teori kebocoran laboratorium, virus tersebut bukan berasal dari satwa liar, melainkan berasal dari Institut Virologi Wuhan (WIV), yang telah lama mempelajari virus corona.

Jaraknya 40 menit berkendara dari pasar. Komunitas intelijen AS diminta untuk menilai kemungkinan kebocoran yang tidak disengaja atau disengaja.

Pada bulan Juni 2023, semua lembaga yang terlibat mengatakan bahwa kebocoran atau sumber hewani adalah skenario yang dapat diterima.

Dewan Intelijen Nasional dan empat lembaga lainnya mengatakan hewan adalah sumbernya. FBI dan Departemen Energi mengira itu adalah insiden laboratorium.

Profesor Anderson berkata: “Bagi banyak orang, ini sepertinya skenario yang sangat mungkin terjadi – ‘Laboratoriumnya ada di sana, sebenarnya itu adalah laboratorium, Anda bodoh?’. Saya sepenuhnya memahami argumen itu.”

Namun, katanya, ada banyak data yang menunjukkan “pasar benar-benar merupakan landasan peluncuran” dan “bahkan posisi di pasar tersebut.”

Mengidentifikasi sumber pandemi dari hewan memberikan petunjuk ke mana para ilmuwan dapat mencari bukti lebih lanjut tentang asal usul hewan.

Namun, karena peternakan memusnahkan hewan mereka pada masa-masa awal Covid, mungkin tidak ada lagi bukti yang dapat ditemukan.

“Kemungkinan besar, kita kehilangan kesempatan,” kata Profesor Worobe.

Profesor Alice Hughes dari Universitas Hong Kong, yang tidak terlibat dalam analisis tersebut, mengatakan ini adalah “studi yang bagus”.

“(Tetapi) tanpa hasil usapan dari hewan sebenarnya di pasar yang belum dikumpulkan, kami tidak bisa mendapatkan kepastian yang tinggi.”

Profesor James Wood, salah satu direktur Cambridge Infectious Diseases, mengatakan penelitian ini memberikan “bukti yang sangat kuat” tentang dimulainya epidemi di kios-kios satwa liar di pasar. Namun, dia mengatakan hal ini tidak akurat karena sampel dikumpulkan setelah pasar tutup, dan epidemi mungkin dimulai beberapa minggu sebelumnya.

Ia memperingatkan bahwa “sedikit atau tidak sama sekali” yang dilakukan untuk membatasi perdagangan hidup satwa liar dan bahwa “penularan penyakit hewan yang tidak terkendali menimbulkan risiko pandemi di masa depan”.